Vi vet hvordan han tenkte og hvordan planene hans tok form, for forskerne har til sammen funnet over 2000 notater med Columbus' håndskrift, i margen, mellom linjene elelr på forsatsbladene i biblioteket han etterlot seg. Notatene er spontane tanker og refleksjoner, nedtegnet i all hast. Han var en kritisk leser kun på ett eneste punkt. Han droppet bøker som ikke stemte med hans egne oppfatninger.